Un día en la microbiología española. Estudio descriptivo de la actividad de los Servicios de Microbiología Clínica

Abstract

El laboratorio es una parte fundamental del trabajo de los Servicios de Microbiología Clínica (SMC). El objetivo de este estudio es medir la actividad de estos laboratorios. Se realizó una encuesta autoadministrada sobre la actividad de un día de trabajo durante octubre de 2007. Los 36 hospitales reportaron 14.076 test, siendo el más solicitado la serología (30,3%), seguido por cultivo de orina (27,8%), hemocultivo (13,2 %), muestras respiratorias (8%), heces (7,1%), uretra (5,8%), piel (5,3%) y líquido cefalorraquídeo (2,6%). Por tipo de microorganismo, el 73,2 % de las muestras correspondía a bacterias (22,9% fueron positivas), el 8,9% a virus (17% de positivos), el 8,1% a hongos (rendimiento: 25,2%), el 5,5% a micobacterias (rendimiento: 5,9%) y a parásitos el 4,5% (positivos: 12,5%). Los sistemas automáticos han sido los más empleados en test de susceptibilidad (62,3%) seguidos de test de difusión (27,1%) y E-test (9,1%). El 5,6% de los antibiogramas demostraron resistencia in vitro a los antibió- ticos. Se han identificado hongos en 108 aislamientos, siendo los más frecuentes Candida (85,1 %) y Aspergillus (8,3%). El origen de estas muestras es: vías respiratorias bajas (32,4%), aparato genital (24,1%), orina (10,2%), sangre (10,2 %) y piel (10,2 %). Se han empleado 12 técnicas de identificación; las más frecuentes han sido las morfológicas (54,8%) y bioquímicas (39,7%). Por servicios se remitieron de Unidades de Cuidados Intensivos (UCI) (20,4%), Cirugía (16,7%), Medicina (29,6%) y Atención Primaria (18,5%). Aunque se ha medido la carga de trabajo de los laboratorios, no se evaluaron aspectos como el procesamiento de los especímenes, la asesoría o la investigación.

The laboratory is an essential part of the work in the Clinical Microbiology Department. This study has aimed to measure the activity of these laboratories. A survey was self-administered on the activity occurring during one work day by each hospital in October 2007. Thirty six hospitals reported 14,076 tests. Serology was the most frequently reported test (30.3%) followed by urine culture (27.8%), blood tests (13.2%), respiratory tract samples (8%), feces (7.1%), urethral (5.8%), skin (5.3%) and cerebrospinal fluid (2.6%). According to species, 73.2% of the isolates were bacteria (22.9% were positive), 8.9% were virus (17% positive), fungi 8.1% (25.2% positive), and 5.5% mycobacterias (5.9% were positive) and parasite 4.5% (12.5% positive). Susceptibility test were performed by automatic methods (62.3%) followed by diffusion test (27.1%) and E-test (9.1%). A total of 5.6% of the susceptibility tests showed in vitro resistance to antibiotics. Fungi were identified in 108 isolates. Candida and Aspergillus were the most frequent genus (85.1% and 8.3%, respectively). Origins of the samples were: lower respiratory tract (32.4%), genital tract (24.1 %), urine (10.2 %), blood (10.2 %) and skin (10.2%). Twelve identification techniques were used, the most frequent being the morphological test (54.8%) and biochemical test (39.7%). Broken down by departments, 20.4% were sent from the ICU, 16.7% from surgery, 29.6% from medicine and 18.5% from primary care. Although the workload of the laboratories has been measured in this work, aspects such as specimen manipulation, clinical advice and research were not considered.